以黑长发女性为目标的连续杀人事件解决数月后，在同一事件现场又发现了新的身份不明的尸体。过去受过创伤的刑警·加贺谷学（千叶雄大）为了探究真相，前往自己曾经逮捕过的连续杀人狂·浦野善治（成田凌）那里。“是你杀的吗?” 面对加贺谷的询问，狱中的浦野透露了自己尊为老师的“M”这个神秘人物的存在。不久，加贺谷

影片根据兵器真人化游戏《刀剑乱舞ONLINE》改编，刀剑男士们将介入织田信长、丰臣秀吉的“本能寺之变”。